همجنسگرایی جزء بیماری‌های اعصاب و روان دسته‌بندی شده و به همین دلیل کسانی که به این اختلال دچار باشند می‌توانند طبق بند 7 ماده 33 آیین‌نامه معافیت پزشکی که مربوط به بیماری‌های اعصاب و روان است، از معافیت سربازی برخوردار شوند. همجنسگرایی و تراجنسی بودن در این بند گنجانده شده و تمامی مشمولان که دچار این اختلالات جنسی باشد باید طبق این بند اقدام کرده و مراحل معافیت را پشت سر بگذارد. معافیت پزشکی همجنسگرایی خدمت سربازی شامل 3 نوع معافیت دائم یا معافیت موقت و یا معاف از خدمات رزم می‌باشد.
افرادی که شامل این بند از معافیت سربازی می‌شوند (معافیت همجنسگرایی) راه دشواری را پیش رو دارند. آنها ممکن است در این راه با توهین و تحقیرهایی روبرو شوند. این افراد باید مراحل معافیت پزشکی را طی کنند و مشکل آنها توسط روانشناس تایید گردد. دقت داشته باشید که افراد تراجنسی و یا همجنسگرا نباید به هیچ وجه از بیان این مسئله احساس خجالت کنند و حتما در پیگیری معافیت پزشکی کوشا باشند چون محیط نظامی در ایران (والبته در بسیاری از نقاط جهان) به هیچ وجه مناسب این دسته از افراد نیست.
مراحل معافیت پزشکی همجنسگرایی خدمت سربازی:
- مشمول باید دفترچه‌ی راهنمای خدمت وظیفه‌ی عمومی را دریافت نماید.
- به یکی از پزشکان معاینه اولیه مراجعه کند.
- برگه خود اظهاری سوابق بیماری مشمول خدمت سربازی را تکمیل کند.
- در سیستم کاربر پلیس +10 درخواست خود را ثبت نماید.
- برگ معرفی از طریق پست به بیمارستان به آدرس مشمول ارسال می‌شود.
- فرد باید جهت انجام معاینات تخصصی به بیمارستان مراجعه نماید.
- جوابیه بیمارستان به حوزه‌ی رسیدگی کننده ارسال می‌شود.
- یک دعوتنامه به آدرس مشمول جهت حضور در شورای پزشکی ارسال می‌گردد.
- جلسه شورای پزشکی برگزار می‌شود.
- در صورتی که این اختلال اثبات گردد، کارت پایان خدمت و یا برگه معافیت مناسبی به متقاضی داده خواهد شد.
